Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STAMBPO95630 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms