Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNH1O95259 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH1O95259 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNH1O95259 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms