Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF4AO95239 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KIF4AO95239 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIF4AO95239 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms