Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PCF11O94913 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PCF11O94913 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PCF11O94913 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCF11O94913 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCF11O94913 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PCF11O94913 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PCF11O94913 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PCF11O94913 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PCF11O94913 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PCF11O94913 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCF11O94913 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCF11O94913 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCF11O94913 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCF11O94913 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCF11O94913 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PCF11O94913 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCF11O94913 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCF11O94913 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCF11O94913 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PCF11O94913 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
PCF11O94913 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PCF11O94913 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PCF11O94913 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PCF11O94913 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PCF11O94913 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PCF11O94913 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PCF11O94913 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCF11O94913 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCF11O94913 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCF11O94913 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCF11O94913 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PCF11O94913 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PCF11O94913 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCF11O94913 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCF11O94913 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCF11O94913 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PCF11O94913 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCF11O94913 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCF11O94913 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PCF11O94913 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PCF11O94913 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PCF11O94913 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PCF11O94913 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCF11O94913 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCF11O94913 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCF11O94913 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PCF11O94913 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PCF11O94913 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PCF11O94913 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCF11O94913 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCF11O94913 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCF11O94913 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCF11O94913 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PCF11O94913 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCF11O94913 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCF11O94913 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCF11O94913 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCF11O94913 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCF11O94913 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PCF11O94913 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PCF11O94913 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PCF11O94913 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PCF11O94913 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PCF11O94913 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PCF11O94913 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PCF11O94913 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PCF11O94913 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PCF11O94913 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PCF11O94913 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PCF11O94913 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PCF11O94913 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PCF11O94913 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCF11O94913 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCF11O94913 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCF11O94913 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCF11O94913 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCF11O94913 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PCF11O94913 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PCF11O94913 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PCF11O94913 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PCF11O94913 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCF11O94913 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCF11O94913 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCF11O94913 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCF11O94913 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCF11O94913 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms