Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRPF6O94906 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF6O94906 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF6O94906 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF6O94906 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms