Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SURF6O75683 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SURF6O75683 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SURF6O75683 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SURF6O75683 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SURF6O75683 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SURF6O75683 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SURF6O75683 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SURF6O75683 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SURF6O75683 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SURF6O75683 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SURF6O75683 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SURF6O75683 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SURF6O75683 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SURF6O75683 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SURF6O75683 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SURF6O75683 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SURF6O75683 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SURF6O75683 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SURF6O75683 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SURF6O75683 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SURF6O75683 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SURF6O75683 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SURF6O75683 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SURF6O75683 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SURF6O75683 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SURF6O75683 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SURF6O75683 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SURF6O75683 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SURF6O75683 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SURF6O75683 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SURF6O75683 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SURF6O75683 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SURF6O75683 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SURF6O75683 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SURF6O75683 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SURF6O75683 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SURF6O75683 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SURF6O75683 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SURF6O75683 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SURF6O75683 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SURF6O75683 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SURF6O75683 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SURF6O75683 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SURF6O75683 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SURF6O75683 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SURF6O75683 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SURF6O75683 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SURF6O75683 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SURF6O75683 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SURF6O75683 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SURF6O75683 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SURF6O75683 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SURF6O75683 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SURF6O75683 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SURF6O75683 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SURF6O75683 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SURF6O75683 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SURF6O75683 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SURF6O75683 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SURF6O75683 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SURF6O75683 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SURF6O75683 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SURF6O75683 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SURF6O75683 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SURF6O75683 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SURF6O75683 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SURF6O75683 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SURF6O75683 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SURF6O75683 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SURF6O75683 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SURF6O75683 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SURF6O75683 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SURF6O75683 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SURF6O75683 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SURF6O75683 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SURF6O75683 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SURF6O75683 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms