Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL3O75679 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFPL3O75679 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL3O75679 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFPL3O75679 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms