Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKRAO75569 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKRAO75569 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKRAO75569 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKRAO75569 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms