Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKAP2O75563 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKAP2O75563 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKAP2O75563 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms