Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH4O75427 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRCH4O75427 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH4O75427 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms