Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG13O75143 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG13O75143 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG13O75143 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG13O75143 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG13O75143 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG13O75143 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG13O75143 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG13O75143 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG13O75143 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG13O75143 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG13O75143 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG13O75143 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG13O75143 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG13O75143 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG13O75143 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG13O75143 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG13O75143 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG13O75143 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG13O75143 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG13O75143 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG13O75143 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG13O75143 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG13O75143 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG13O75143 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG13O75143 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG13O75143 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG13O75143 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG13O75143 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG13O75143 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG13O75143 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG13O75143 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG13O75143 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG13O75143 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG13O75143 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG13O75143 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG13O75143 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG13O75143 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG13O75143 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG13O75143 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG13O75143 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG13O75143 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG13O75143 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG13O75143 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG13O75143 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG13O75143 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG13O75143 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG13O75143 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG13O75143 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG13O75143 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG13O75143 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG13O75143 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG13O75143 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG13O75143 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG13O75143 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG13O75143 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG13O75143 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG13O75143 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG13O75143 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG13O75143 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG13O75143 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG13O75143 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG13O75143 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG13O75143 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG13O75143 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG13O75143 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms