Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOL3O60936 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOL3O60936 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOL3O60936 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOL3O60936 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOL3O60936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOL3O60936 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOL3O60936 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOL3O60936 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NOL3O60936 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NOL3O60936 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOL3O60936 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOL3O60936 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NOL3O60936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOL3O60936 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOL3O60936 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOL3O60936 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NOL3O60936 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOL3O60936 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOL3O60936 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOL3O60936 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOL3O60936 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOL3O60936 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOL3O60936 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOL3O60936 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOL3O60936 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOL3O60936 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOL3O60936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOL3O60936 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOL3O60936 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOL3O60936 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOL3O60936 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOL3O60936 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOL3O60936 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOL3O60936 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOL3O60936 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOL3O60936 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOL3O60936 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOL3O60936 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOL3O60936 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOL3O60936 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOL3O60936 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOL3O60936 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOL3O60936 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms