Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF9O60383 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF9O60383 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF9O60383 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF9O60383 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF9O60383 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF9O60383 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDF9O60383 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF9O60383 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDF9O60383 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF9O60383 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDF9O60383 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF9O60383 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF9O60383 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF9O60383 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF9O60383 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF9O60383 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF9O60383 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF9O60383 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF9O60383 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF9O60383 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF9O60383 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF9O60383 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF9O60383 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF9O60383 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF9O60383 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF9O60383 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF9O60383 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF9O60383 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF9O60383 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF9O60383 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF9O60383 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF9O60383 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF9O60383 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF9O60383 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF9O60383 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF9O60383 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF9O60383 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF9O60383 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF9O60383 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF9O60383 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF9O60383 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF9O60383 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF9O60383 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF9O60383 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF9O60383 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms