Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGRN1O60291 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGRN1O60291 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms