Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP9BO43861 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9BO43861 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP9BO43861 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms