Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHP2O43745 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHP2O43745 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHP2O43745 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP2O43745 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP2O43745 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP2O43745 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP2O43745 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHP2O43745 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP2O43745 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP2O43745 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP2O43745 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHP2O43745 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHP2O43745 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP2O43745 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP2O43745 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP2O43745 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHP2O43745 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP2O43745 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHP2O43745 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP2O43745 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP2O43745 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP2O43745 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP2O43745 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHP2O43745 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP2O43745 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP2O43745 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP2O43745 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP2O43745 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHP2O43745 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP2O43745 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP2O43745 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHP2O43745 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP2O43745 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP2O43745 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP2O43745 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHP2O43745 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHP2O43745 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP2O43745 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP2O43745 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP2O43745 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP2O43745 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP2O43745 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP2O43745 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP2O43745 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHP2O43745 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP2O43745 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP2O43745 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP2O43745 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP2O43745 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP2O43745 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP2O43745 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP2O43745 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP2O43745 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms