Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HTATSF1O43719 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HTATSF1O43719 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HTATSF1O43719 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HTATSF1O43719 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms