Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF4O43474 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF4O43474 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF4O43474 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF4O43474 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF4O43474 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF4O43474 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF4O43474 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF4O43474 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF4O43474 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF4O43474 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF4O43474 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF4O43474 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF4O43474 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF4O43474 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF4O43474 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF4O43474 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF4O43474 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF4O43474 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF4O43474 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF4O43474 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF4O43474 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF4O43474 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF4O43474 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF4O43474 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF4O43474 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF4O43474 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF4O43474 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF4O43474 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF4O43474 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF4O43474 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF4O43474 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF4O43474 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF4O43474 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF4O43474 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF4O43474 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF4O43474 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF4O43474 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF4O43474 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF4O43474 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF4O43474 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF4O43474 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF4O43474 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF4O43474 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF4O43474 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF4O43474 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF4O43474 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF4O43474 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF4O43474 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF4O43474 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF4O43474 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms