Protein–RNA interactions for Protein: O43390

HNRNPR, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPRO43390 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HNRNPRO43390 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNRNPRO43390 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNRNPRO43390 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms