Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBDO15205 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBDO15205 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBDO15205 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBDO15205 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBDO15205 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBDO15205 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBDO15205 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBDO15205 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBDO15205 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBDO15205 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBDO15205 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBDO15205 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBDO15205 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBDO15205 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBDO15205 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBDO15205 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBDO15205 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBDO15205 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBDO15205 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBDO15205 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBDO15205 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBDO15205 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBDO15205 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBDO15205 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBDO15205 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBDO15205 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBDO15205 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBDO15205 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBDO15205 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBDO15205 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBDO15205 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBDO15205 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBDO15205 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms