Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SETD1AO15047 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SETD1AO15047 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SETD1AO15047 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SETD1AO15047 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SETD1AO15047 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms