Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RGPD8O14715 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD8O14715 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD8O14715 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms