Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTDSP2O14595 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP2O14595 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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