Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPEO14579 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPEO14579 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPEO14579 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPEO14579 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPEO14579 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPEO14579 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPEO14579 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPEO14579 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPEO14579 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPEO14579 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPEO14579 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPEO14579 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPEO14579 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPEO14579 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPEO14579 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPEO14579 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPEO14579 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPEO14579 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPEO14579 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPEO14579 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPEO14579 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPEO14579 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPEO14579 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPEO14579 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPEO14579 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPEO14579 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPEO14579 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPEO14579 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPEO14579 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPEO14579 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPEO14579 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPEO14579 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPEO14579 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPEO14579 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COPEO14579 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPEO14579 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPEO14579 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPEO14579 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPEO14579 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPEO14579 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPEO14579 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPEO14579 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPEO14579 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPEO14579 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COPEO14579 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms