Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CUX2O14529 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CUX2O14529 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CUX2O14529 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
CUX2O14529 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CUX2O14529 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CUX2O14529 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CUX2O14529 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CUX2O14529 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CUX2O14529 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CUX2O14529 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CUX2O14529 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
CUX2O14529 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
CUX2O14529 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CUX2O14529 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CUX2O14529 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CUX2O14529 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CUX2O14529 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CUX2O14529 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
CUX2O14529 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CUX2O14529 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CUX2O14529 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
CUX2O14529 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CUX2O14529 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CUX2O14529 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CUX2O14529 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CUX2O14529 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CUX2O14529 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CUX2O14529 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
CUX2O14529 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CUX2O14529 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CUX2O14529 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CUX2O14529 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CUX2O14529 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CUX2O14529 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CUX2O14529 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CUX2O14529 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CUX2O14529 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CUX2O14529 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CUX2O14529 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CUX2O14529 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
CUX2O14529 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CUX2O14529 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CUX2O14529 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CUX2O14529 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CUX2O14529 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CUX2O14529 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CUX2O14529 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CUX2O14529 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CUX2O14529 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CUX2O14529 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CUX2O14529 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CUX2O14529 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CUX2O14529 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CUX2O14529 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
CUX2O14529 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CUX2O14529 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CUX2O14529 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CUX2O14529 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CUX2O14529 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CUX2O14529 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CUX2O14529 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CUX2O14529 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CUX2O14529 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CUX2O14529 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CUX2O14529 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CUX2O14529 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CUX2O14529 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CUX2O14529 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CUX2O14529 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CUX2O14529 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CUX2O14529 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CUX2O14529 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CUX2O14529 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CUX2O14529 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CUX2O14529 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CUX2O14529 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CUX2O14529 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CUX2O14529 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CUX2O14529 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CUX2O14529 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CUX2O14529 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CUX2O14529 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CUX2O14529 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CUX2O14529 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
CUX2O14529 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CUX2O14529 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CUX2O14529 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CUX2O14529 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CUX2O14529 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CUX2O14529 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CUX2O14529 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CUX2O14529 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CUX2O14529 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
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