Protein–RNA interactions for Protein: O14519

CDK2AP1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP1O14519 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2AP1O14519 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2AP1O14519 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2AP1O14519 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2AP1O14519 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2AP1O14519 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2AP1O14519 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms