Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP6CO00743 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP6CO00743 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP6CO00743 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP6CO00743 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms