Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PODXLO00592 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PODXLO00592 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PODXLO00592 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PODXLO00592 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PODXLO00592 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PODXLO00592 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PODXLO00592 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PODXLO00592 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PODXLO00592 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PODXLO00592 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PODXLO00592 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PODXLO00592 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PODXLO00592 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PODXLO00592 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PODXLO00592 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXLO00592 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXLO00592 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXLO00592 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PODXLO00592 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXLO00592 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXLO00592 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXLO00592 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXLO00592 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PODXLO00592 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PODXLO00592 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXLO00592 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXLO00592 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PODXLO00592 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PODXLO00592 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXLO00592 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXLO00592 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXLO00592 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXLO00592 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PODXLO00592 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PODXLO00592 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PODXLO00592 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXLO00592 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PODXLO00592 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXLO00592 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXLO00592 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXLO00592 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXLO00592 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXLO00592 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXLO00592 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXLO00592 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXLO00592 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXLO00592 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXLO00592 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXLO00592 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXLO00592 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXLO00592 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXLO00592 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXLO00592 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXLO00592 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXLO00592 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXLO00592 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXLO00592 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXLO00592 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXLO00592 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXLO00592 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXLO00592 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXLO00592 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXLO00592 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXLO00592 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXLO00592 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXLO00592 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXLO00592 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXLO00592 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXLO00592 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXLO00592 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXLO00592 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXLO00592 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms