Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 NPNT-206ENST00000504304 543 ntTSL 415.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 STK19-217ENST00000519179 1101 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 227.91■■■□□ 2.062e-14■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-14■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.782e-14■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 FGD5-AS1-201ENST00000417835 1630 ntTSL 1 (best)25.49■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 54.4
DDX3XO00571 FGD5-AS1-205ENST00000440079 1527 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 54.4
DDX3XO00571 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 54.4
DDX3XO00571 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.214e-13■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-212ENST00000512125 975 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-206ENST00000503835 896 ntTSL 514.86□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-210ENST00000508467 577 ntTSL 213.62□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-208ENST00000506164 443 ntTSL 313.56□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-204ENST00000502826 401 ntTSL 313.37□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-213ENST00000514838 1984 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-214ENST00000515285 785 ntTSL 312.46□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 POC5-209ENST00000507421 588 ntTSL 37.08□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 54.3
DDX3XO00571 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 54.1
DDX3XO00571 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 54.1
DDX3XO00571 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 54
DDX3XO00571 ZDHHC9-203ENST00000406492 737 ntTSL 512.48□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 54
DDX3XO00571 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.39e-11■■■■■ 54
DDX3XO00571 SCAMP1-205ENST00000614488 1276 ntTSL 1 (best)7.39□□□□□ -1.239e-11■■■■■ 54
DDX3XO00571 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.49e-11■■■■■ 54
DDX3XO00571 SCAMP1-204ENST00000511551 559 ntTSL 45.3□□□□□ -1.569e-11■■■■■ 54
DDX3XO00571 S100A1-204ENST00000436839 236 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-29■■■■■ 53.9
DDX3XO00571 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)12.28□□□□□ -0.442e-29■■■■■ 53.9
DDX3XO00571 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-29■■■■■ 53.9
DDX3XO00571 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-29■■■■■ 53.9
DDX3XO00571 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.252e-29■■■■■ 53.9
DDX3XO00571 SPPL2A-207ENST00000560288 742 ntTSL 217.22■□□□□ 0.351e-9■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-9■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 TUSC2-204ENST00000454201 735 ntTSL 522.37■■□□□ 1.179e-14■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.059e-14■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 TUSC2-206ENST00000463304 475 ntTSL 220.18■□□□□ 0.829e-14■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 TUSC2-202ENST00000417867 561 ntTSL 519.99■□□□□ 0.799e-14■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 TUSC2-203ENST00000421918 790 ntTSL 518.65■□□□□ 0.589e-14■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.437e-10■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 ARL2BP-204ENST00000565794 234 ntTSL 521.91■■□□□ 1.17e-10■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.065e-49■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 215.42■□□□□ 0.065e-49■■■■■ 53.8
DDX3XO00571 CCDC57-219ENST00000584717 513 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 CCDC57-204ENST00000392345 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 CCDC57-218ENST00000583593 429 ntTSL 313.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 RMDN3-208ENST00000560460 931 ntTSL 519.92■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 RMDN3-207ENST00000558777 2139 ntTSL 218.65■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 RMDN3-211ENST00000560905 1008 ntTSL 218.56■□□□□ 0.563e-7■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.817e-8■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 ALG2-201ENST00000238477 2966 ntTSL 218.33■□□□□ 0.527e-8■■■■■ 53.7
DDX3XO00571 ZSCAN29-205ENST00000563508 701 ntTSL 317.43■□□□□ 0.381e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 SELENOS-206ENST00000529968 556 ntTSL 228.15■■■□□ 2.19e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 SELENOS-202ENST00000526043 2444 ntTSL 222.72■■□□□ 1.239e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 SELENOS-204ENST00000527833 856 ntTSL 217.69■□□□□ 0.429e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.196e-23■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.119e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 SELENOS-208ENST00000534014 355 ntTSL 214.78□□□□□ -0.049e-10■■■■■ 53.6
DDX3XO00571 ISOC2-206ENST00000589108 706 ntTSL 214.79□□□□□ -0.048e-15■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 TRAF4-207ENST00000461195 787 ntTSL 223.1■■□□□ 1.297e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.27e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 TRAF4-204ENST00000422344 631 ntTSL 322.41■■□□□ 1.187e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.167e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.737e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 TRAF4-216ENST00000586813 789 ntTSL 319.35■□□□□ 0.697e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-227ENST00000637730 2735 ntTSL 516.27■□□□□ 0.193e-11■■■■■ 53.4
DDX3XO00571 DDR1-279ENST00000515529 340 ntTSL 426.95■■□□□ 1.99e-8■■■■■ 53.3
DDX3XO00571 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.69e-8■■■■■ 53.3
DDX3XO00571 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.29e-8■■■■■ 53.3
DDX3XO00571 SQSTM1-210ENST00000506042 921 ntTSL 220.84■□□□□ 0.939e-8■■■■■ 53.3
DDX3XO00571 DDR1-243ENST00000482050 246 ntTSL 518.17■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 53.3
DDX3XO00571 B4GALT6-205ENST00000579372 339 ntTSL 54.5□□□□□ -1.699e-8■■■■■ 53.3
DDX3XO00571 PIAS2-202ENST00000398654 2043 ntTSL 1 (best)27.31■■□□□ 1.969e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-205ENST00000586170 332 ntTSL 326.48■■□□□ 1.839e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.259e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-211ENST00000590127 1838 ntTSL 1 (best)22.36■■□□□ 1.179e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-210ENST00000589917 561 ntTSL 513.18□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-208ENST00000587810 447 ntTSL 510.72□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-216ENST00000592221 502 ntTSL 510.72□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 PIAS2-214ENST00000592011 1394 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 53.2
DDX3XO00571 ELP5-215ENST00000576496 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 316.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-211ENST00000565425 1918 ntTSL 521.67■■□□□ 1.069e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-210ENST00000565341 1488 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.059e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.949e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.89e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-204ENST00000562752 960 ntTSL 219.9■□□□□ 0.789e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 SPPL3-208ENST00000543854 508 ntTSL 519.57■□□□□ 0.729e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-212ENST00000565693 593 ntTSL 418.48■□□□□ 0.559e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-215ENST00000567172 499 ntTSL 217.75■□□□□ 0.439e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.419e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-220ENST00000570066 565 ntTSL 417.33■□□□□ 0.369e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.359e-11■■■■■ 53.1
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