Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EBAG9O00559 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EBAG9O00559 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBAG9O00559 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBAG9O00559 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms