Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
O00370 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
O00370 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
O00370 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
O00370 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
O00370 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
O00370 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
O00370 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
O00370 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
O00370 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
O00370 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
O00370 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
O00370 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
O00370 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
O00370 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
O00370 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
O00370 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
O00370 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
O00370 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
O00370 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
O00370 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
O00370 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
O00370 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
O00370 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
O00370 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
O00370 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
O00370 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
O00370 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
O00370 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
O00370 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
O00370 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
O00370 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
O00370 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
O00370 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
O00370 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
O00370 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
O00370 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
O00370 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
O00370 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
O00370 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
O00370 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
O00370 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
O00370 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
O00370 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
O00370 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
O00370 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
O00370 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
O00370 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
O00370 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
O00370 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
O00370 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
O00370 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
O00370 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
O00370 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
O00370 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
O00370 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
O00370 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
O00370 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
O00370 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
O00370 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
O00370 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
O00370 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms