Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2K7ER74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms