Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC01387J3KSC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC01387J3KSC0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms