Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCER2I3L3R5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCER2I3L3R5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCER2I3L3R5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms