Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H7C1C5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H7C1C5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H7C1C5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H7C1C5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H7C1C5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H7C1C5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H7C1C5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H7C1C5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H7C1C5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H7C1C5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H7C1C5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H7C1C5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H7C1C5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H7C1C5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H7C1C5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H7C1C5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H7C1C5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1C5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H7C1C5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1C5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1C5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H7C1C5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1C5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1C5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1C5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1C5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1C5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H7C1C5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1C5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1C5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1C5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1C5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H7C1C5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1C5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1C5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1C5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H7C1C5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H7C1C5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1C5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1C5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1C5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1C5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H7C1C5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1C5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1C5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1C5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1C5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1C5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H7C1C5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H7C1C5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1C5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1C5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1C5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H7C1C5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1C5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1C5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1C5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1C5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1C5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H7C1C5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1C5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1C5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1C5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1C5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H7C1C5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms