Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms