Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB8E9PQR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB8E9PQR5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms