Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4E171 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4E171 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4E171 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4E171 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4E171 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4E171 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
B4E171 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B4E171 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4E171 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4E171 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4E171 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B4E171 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4E171 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4E171 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4E171 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4E171 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4E171 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4E171 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4E171 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4E171 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4E171 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4E171 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4E171 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4E171 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4E171 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4E171 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4E171 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4E171 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
B4E171 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
B4E171 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4E171 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
B4E171 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
B4E171 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B4E171 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4E171 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4E171 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4E171 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4E171 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4E171 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4E171 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4E171 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4E171 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4E171 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4E171 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4E171 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4E171 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4E171 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4E171 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4E171 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4E171 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4E171 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4E171 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4E171 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B4E171 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms