Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF839A8K0R7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF839A8K0R7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF839A8K0R7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms