Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK7

CPSF4L, Putative cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF4LA6NMK7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPSF4LA6NMK7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPSF4LA6NMK7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF4LA6NMK7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms