Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGAP5A6NIR3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP5A6NIR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP5A6NIR3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms