Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GLTPD2A6NH11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GLTPD2A6NH11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GLTPD2A6NH11 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GLTPD2A6NH11 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms