Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MAP1LC3B2A6NCE7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms