Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POTEFA5A3E0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POTEFA5A3E0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POTEFA5A3E0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEFA5A3E0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEFA5A3E0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POTEFA5A3E0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POTEFA5A3E0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POTEFA5A3E0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POTEFA5A3E0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms