Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF27A3QJZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF27A3QJZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF27A3QJZ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF27A3QJZ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms