Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CLRN2A0PK11 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLRN2A0PK11 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLRN2A0PK11 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLRN2A0PK11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms