Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PQD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PQD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms