Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RQJ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RQJ8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RQJ8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RQJ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms