Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087WWV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WWV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WWV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WWV3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WWV3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WWV3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087WWV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087WWV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WWV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WWV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WWV3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087WWV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A087WWV3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A087WWV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WWV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WWV3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WWV3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087WWV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WWV3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WWV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WWV3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WWV3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087WWV3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A087WWV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087WWV3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms