Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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